Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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TTC16Q8NEE8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTC16Q8NEE8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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