Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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LNX2Q8N448 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LNX2Q8N448 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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