Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00523Q86TU6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms