Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms