Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MAGEB16-202ENST00000399987 1736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms