Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms