Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms