Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms