Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTF1Q16619 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms