Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLFQ16534 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms