Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GRIK4Q16099 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GRIK4Q16099 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GRIK4Q16099 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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