Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SURF2Q15527 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms