Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms