Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms