Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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