Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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