Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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