Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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MAP3K1Q13233 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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MAP3K1Q13233 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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MAP3K1Q13233 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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MAP3K1Q13233 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K1Q13233 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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