Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP3Q12983 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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