Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms