Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms