Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LOXL1Q08397 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms