Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms