Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP5P82980 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms