Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSCP56915 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSCP56915 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms