Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms