Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCA2P51587 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms