Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2C2P49116 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms