Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PIP4K2AP48426 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms