Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms