Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms