Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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