Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.8 ms