Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.7 ms