Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1P29120 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms