Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN3P26045 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms