Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms