Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA4P06727 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA4P06727 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms