Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3P05106 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms