Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMP1P01033 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms