Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms