Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCATO75600 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCATO75600 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms