Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms