Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PHF1O43189 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHF1O43189 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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