Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-2B6SEH9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms