Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms