Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL13PA6NNM8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms