Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CFAP73A6NFT4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CFAP73A6NFT4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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