Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms