Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEU3Q9UQ49 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms